Генов беше изваден от нарядите без конкретни обяснения миналата пролет. През лятото високопоставен чиновник от дисциплинарната комисия на УЕФА привика във Виена шефа на съдийската комисия на БФС Борислав Александров и началника на софийската колегия Антон Василев, за да отговарят на цял наръчник въпроси за инциденти с наши рефери, убийства на клубни босове, съмнителни мачове и т.н. Стана ясно, че в резултат на сигнали е възбудена мащабна проверка по подозрения за измами със залози. Разпитващ е бил лично д-р Герхард Капъл, инспектор на УЕФА по специалните случаи.
От БФС упорито мълчаха по случая или увъртаха с обяснения, че това били рутинни проверки. Неофициално плъзна слух, че пет отбора (Вихрен, Марек, Беласица, Спартак и Локо/Сф) са под лупа заради огромни печалби от техни мачове, а като част от разследването има подозрения към Антон Генов по повод точни залози на определен брой показани картони. Чистите факти са два: на 15 февруари 2007 г. Генов, в екип с помощниците Никола Джугански и Красимир Керезов и четвъртия рефер Цветан Георгиев, свири мача за Купата на УЕФА "Зулте Варегем" - "Нюкасъл" 1:3 и получава добра оценка от делегата на УЕФА, но и двата клуба подават жалби за показани общо 6 жълти картона и спорна дузпа за английския тим. На 24 март Генов трябва да ръководи евроквалификацията Полша - Азербайджан, но два дни преди мача е свален с писмо на УЕФА без посочени мотиви.
Осем месеца по-късно Генов се завръща в нарядите. На 29 ноември ще ръководи "Хелзингборг" - "Аустрия Виена" от третия кръг в група Н за Купата на УЕФА. Шведският отбор има 4 точки от два мача и заема второ място след "Бордо" (6 от 2), а австрийският е без спечелена от един изигран. В групата са още "Паниониос" (1 точка от 1 мач) и "Галатасарай" (0 от 2).
